Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SafbD3YXK2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms