Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms