Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms