Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Phf11bB4XVQ1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Phf11bB4XVQ1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Phf11bB4XVQ1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Phf11bB4XVQ1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
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Phf11bB4XVQ1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Phf11bB4XVQ1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Phf11bB4XVQ1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Phf11bB4XVQ1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Phf11bB4XVQ1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Phf11bB4XVQ1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Phf11bB4XVQ1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Phf11bB4XVQ1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Phf11bB4XVQ1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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