Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms