Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms