Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm2012B1B0R1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm2012B1B0R1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm2012B1B0R1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm2012B1B0R1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm2012B1B0R1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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