Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn8B1ARD8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slfn8B1ARD8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms