Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms