Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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