Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms