Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms