Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms