Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SktA2AQ25 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms