Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Scn1aA2APX8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Scn1aA2APX8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Scn1aA2APX8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Scn1aA2APX8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Scn1aA2APX8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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