Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SetxA2AKX3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms