Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SW31

BC029722, cDNA sequence BC029722, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC029722A0A0N4SW31 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
BC029722A0A0N4SW31 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms