Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms