Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd2V9GX34 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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