Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm4T1NXB5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Vstm4T1NXB5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Vstm4T1NXB5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms