Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Top3bQ9Z321 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Top3bQ9Z321 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Top3bQ9Z321 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Top3bQ9Z321 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Top3bQ9Z321 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Top3bQ9Z321 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Top3bQ9Z321 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Top3bQ9Z321 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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