Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms