Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uso1Q9Z1Z0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uso1Q9Z1Z0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms