Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms