Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R3

Apom, Apolipoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApomQ9Z1R3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApomQ9Z1R3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApomQ9Z1R3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApomQ9Z1R3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApomQ9Z1R3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApomQ9Z1R3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApomQ9Z1R3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApomQ9Z1R3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApomQ9Z1R3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApomQ9Z1R3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
ApomQ9Z1R3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
ApomQ9Z1R3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApomQ9Z1R3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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