Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0X0

Cdc42ep5, Cdc42 effector protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep5Q9Z0X0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms