Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx1Q9WV80 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx1Q9WV80 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx1Q9WV80 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx1Q9WV80 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx1Q9WV80 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx1Q9WV80 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Snx1Q9WV80 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Snx1Q9WV80 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Snx1Q9WV80 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Snx1Q9WV80 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Snx1Q9WV80 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Snx1Q9WV80 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Snx1Q9WV80 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Snx1Q9WV80 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Snx1Q9WV80 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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