Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms