Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trpc2Q9R244 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms