Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms