Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Nphs1Q9QZS7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Nphs1Q9QZS7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Nphs1Q9QZS7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Nphs1Q9QZS7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Nphs1Q9QZS7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Nphs1Q9QZS7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Nphs1Q9QZS7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphs1Q9QZS7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
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Nphs1Q9QZS7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphs1Q9QZS7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Nphs1Q9QZS7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphs1Q9QZS7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphs1Q9QZS7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphs1Q9QZS7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphs1Q9QZS7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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