Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rnf4Q9QZS2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rnf4Q9QZS2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rnf4Q9QZS2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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