Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Col4a3Q9QZS0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Col4a3Q9QZS0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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