Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Usp21Q9QZL6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
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Usp21Q9QZL6 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
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Usp21Q9QZL6 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Usp21Q9QZL6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Usp21Q9QZL6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Usp21Q9QZL6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Usp21Q9QZL6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Usp21Q9QZL6 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Usp21Q9QZL6 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms