Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gpc1Q9QZF2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gpc1Q9QZF2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gpc1Q9QZF2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gpc1Q9QZF2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gpc1Q9QZF2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gpc1Q9QZF2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gpc1Q9QZF2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gpc1Q9QZF2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gpc1Q9QZF2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gpc1Q9QZF2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gpc1Q9QZF2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gpc1Q9QZF2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gpc1Q9QZF2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gpc1Q9QZF2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc1Q9QZF2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc1Q9QZF2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc1Q9QZF2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc1Q9QZF2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms