Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms