Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms