Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Kcnip3Q9QXT8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Kcnip3Q9QXT8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Kcnip3Q9QXT8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Kcnip3Q9QXT8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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