Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms