Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chaf1aQ9QWF0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms