Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Dkk3Q9QUN9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dkk3Q9QUN9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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