Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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