Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms