Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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