Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Col5a3Q9JLI2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Col5a3Q9JLI2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Col5a3Q9JLI2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Col5a3Q9JLI2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Col5a3Q9JLI2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Col5a3Q9JLI2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Col5a3Q9JLI2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Col5a3Q9JLI2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Col5a3Q9JLI2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms