Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms