Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK91

Mlh1, DNA mismatch repair protein Mlh1, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mlh1Q9JK91 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mlh1Q9JK91 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mlh1Q9JK91 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms