Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gfra4Q9JJT2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gfra4Q9JJT2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gfra4Q9JJT2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gfra4Q9JJT2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gfra4Q9JJT2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gfra4Q9JJT2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gfra4Q9JJT2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms