Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Riox1Q9JJF3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Riox1Q9JJF3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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