Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ccl28Q9JIL2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms